molezz BAR 世界尽头

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地铁2号线 -从北京站出发 – 10.6 公里 – 到达西直门 – 634路(360慢) – 从西直门出发 – 18.7 公里 – 到达北京植物园南门 – 前往北京市海淀区香山南辛村20号（需要大约 98 米）

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最近由于在课题中发现氨基酸序列在pfam中又有了新的预测结果(SMART中没有,看来pfam数据更新更频繁),于是又需要进行一些序列的二级及三级结构简单预测,并进行相关的观察,由于很久没有搞这些东西了,有点生疏,于是重新尝试看pdb文件的软件,以前用的protein explorer和yasara感觉不太好用了…于是又发现了一个很不错的开源分子可视软件–PyMOL (下载).

比起yasara, PyMOL运行更迅速,跨平台(mac, win和linux都能用), 虽然yasara的渲染很不错,不过PyMOL也能导出为povray格式进行渲染.Protein explorer太老了,只能运行于firefox2.0以下和IE6, 我的电脑上都没有.

PyMOL打开界面分3块,viewer,console和GUI(如图), 一般来说大部分简单的观察通过viewer就行了, 操作不是很复杂. 举个列子,如果要用cartoon形式观察蛋白分子,打开pdb文件,比较乱,可以先hide everything, 然后选择show cartonn(其他依次类推,show surface,show ribbon等等), 然后进行上色, 即color, 比如 by ss -> helix sheet loop 就将分子按照螺旋, 折叠和loop进行染色, 方便观察比较.
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植物分子暑期班过半,听了2天的报告,今天由于要提取RNA,所以没去.虽然我不喜欢听报告讲座,但是也不得不承认总是有收获的…

原先接触到一个外源添加实验,本来希望通过外源添加一些试剂去影响植物的表型,结果没有得到结果.这次讲座中正好听到一模一样的实验想法,也是外源试剂没有影响,不过并不代表这一试剂本身没有影响,而是可能由于各种各样的原因试剂没有到达所需部位,不过他们实验室使用了一个构建进行内源表达,得到了预期的结果,挺不错,也许打算去要过来自己也做下尝试…

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入手黑莓8310一周了,很快习惯了全键盘的输入,虽然原来用的w950i触摸手写,不过发现还是全键输入快些.用黑莓很大一个应用自然是email的收发,在比较了尚邮,berrymail和139以后,我最终选择了berrymail,整合在系统中的无缝设计我非常喜欢,所有快捷键都能用,就像源生的服务一样,完全感受不到安装了一个第三方程序.

和原先的索爱w950i比起来,唯一不习惯的就是上网浏览,指哪点哪的日子没有了,需要用轨迹球移动到链接..碰到多的就有些麻烦咯,不过这是比较下来唯一的缺陷.一般使用2者电池使用量基本差不多,媒体播放方面w950i的控制明显好很多,在电力方面我觉得索爱还是控制的非常好的,不过我现在不用手机听mp3了…so电池2者基本没差别了,2-3天吧.屏幕方面,黑莓在太阳下也很清楚..w950i就不太行咯.

虽然考虑过8820,不过最后还是选了8310,毕竟wifi的用处不是很大,有wifi的地方基本我的本本都在,而摄像头就实在多了,在gps的辅助下还能把经纬度写进照片信息,结合google map非常好玩.另外酒红色的8310也很漂亮,体积也比88小些.

黑莓的软件不如wm和sb多,不过足够用了,毕竟只是手机不是pc,现在主要装了以下这些,够用了,主题用了莓控小小的palm pre:
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给了5颗星.很简单..和我的人生观如出一辙

很不错很有想法很现实的片子
总有人说,如果让我再选一次,我一定换个选择
其实,当历史重演,我还是会这样选择,绝不后悔.
　　
故事很精彩,很轻松的表达出不轻松的问题,每个人长大都会思考的问题:以前选择了A,当时间回到那一点,哪怕知道未来,难道就会选择B吗?…人生也许就是这样~~

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